Si funksionon testimi i rezistencës gjenetike të HIV?

Genotipizimi dhe fenotipizimi mund të identifikojnë, madje edhe të parashikojnë, rezistencën ndaj HIV

Edhe për njerëzit me aderencë optimale ndaj terapisë, një shkallë e rezistencës së drogës së HIV pritet të zhvillohet me kalimin e kohës për shkak të mutacioneve natyrore të virusit. Në raste të tjera, rezistenca mund të zhvillohet me shpejtësi kur aderenca nënoptimale lejon që popullatat rezistente të VIH të lulëzojnë, duke çuar përfundimisht në dështimin e trajtimit.

Kur dështimi i trajtimit të ndodhë, duhet të përzgjidhen kombinime alternative të drogës me qëllim që të shtypni këtë popullsi të re të virusit rezistent.

Testimi i rezistencës gjenetike ndihmon në lehtësimin e kësaj duke identifikuar llojet e mutacioneve rezistente në "pishën virale" të një personi, ndërsa përcakton se sa të ndjeshëm janë viruset për agjentë të mundshëm antiretrovirale .

Dy mjete primare përdoren për testimin e rezistencës gjenetike në HIV: testin gjenotipik të HIV dhe analizën fenotipike të HIV .

Cili është një gjenotip dhe një fenotip?

Sipas përkufizimit, një gjenotip është thjesht përbërësi gjenetik i një organizmi, ndërsa një fenotip është karakteristikat ose tiparet e dukshme të atij organizmi.

Analizat gjenotipike (ose gjenotipizimi) funksionojnë duke identifikuar udhëzimet e trashëguara brenda kodimit gjenetik të një qelize ose ADN. Testet fenotipike (ose fenotipizimi) konfirmojnë shprehjen e këtyre udhëzimeve nën ndikimin e kushteve të ndryshme mjedisore.

Ndërsa asociacioni ndërmjet gjenotipit dhe fenotipit nuk është absolut, genotipizimi shpesh mund të jetë parashikues i fenotipit, veçanërisht kur ndryshimet në kodin gjenetik u japin ndryshime të pritshme në tipare ose karakteristika - si në rastin e zhvillimit të rezistencës së drogës.

Fenotipizimi, nga ana tjetër, konfirmon "këtu-dhe-tani". Synon të vlerësojë reagimin e një organizmi ndaj ndryshimeve specifike në presionin mjedisor, siç është kur HIV është i ekspozuar ndaj ilaçeve të ndryshme dhe / ose përqendrimeve të drogës.

Shpjegimi i gjenotipizimit të HIV

Gjenotipizmi i HIV është në përgjithësi teknologjia më e zakonshme e përdorur për testimin e rezistencës.

Qëllimi i analizës është të zbulojë mutacione të veçanta gjenetike në rajonin gag-polgjenomit të virusit (ose kodit gjenetik). Ky është rajoni ku transkriptazën e reversës, enzimat e proteazës dhe integrazës - objektivat e shumicës së barnave antiretrovirale - janë të koduara në zinxhirin e ADN-së.

Duke parë përforcimin e gjenomit të VIH duke përdorur teknologjinë e reaksionit zinxhir të polimerazës (PCR) , teknikët e laboratorit mund të sekuencojnë (ose "hartë") gjenetikën e virusit duke përdorur teknologji të ndryshme të zbulimit të mutacionit.

Mutacionet e tezës (ose akumulimi i mutacioneve) interpretohen nga teknikët që analizojnë marrëdhënien midis mutacioneve të identifikuara dhe virusit 'ndjeshmërinë e pritur ndaj ilaçeve të ndryshme antiretrovirale. Bazat e të dhënave online mund të ndihmojnë duke krahasuar sekuencën e testimit me atë të një prototipi të virusit "të egër" (dmth., HIV që nuk përmban mutacione rezistente).

Interpretimi i këtyre testeve përdoret për të përcaktuar ndjeshmërinë e barit, me numrin më të madh të mutacioneve kryesore që u japin niveleve më të larta të rezistencës ndaj drogës .

Shpjegimi i fenomeneve të HIV

Fenotipizimi HIV vlerëson rritjen e HIV-it të personit në praninë e një droge, pastaj e krahason atë me rritjen e një kontrolli, virusi i egër në të njëjtin medikament.

Sikurse me analizat gjenotipike, testet fenotipike përforcojnë rajonin gag-pol të gjenomit të HIV.

Kjo pjesë e kodit gjenetik pastaj "shndërrohet" në një klon të tipit të egër duke përdorur teknologjinë e rekombinant të ADN-së . Virusi rekombinant që rezulton përdoret për të infektuar qelizat e gjitarëve in vitro (në laborator).

Mostra virale ekspozohet më pas në përqëndrime në rritje të barnave të ndryshme antiretrovirale deri në 50% dhe 90% të shtypjes virale. Përqendrimet pastaj krahasohen me rezultatet nga kontrolli, mostra e tipit të egër.

Ndryshimet relative "dele" ofrojnë gamën e vlerës me të cilën përcaktohet ndjeshmëria e drogës. Një ndryshim katër-fish thjesht do të thotë se katër herë sasinë e drogës ishte e nevojshme për të arritur shtypjen virale në krahasim me atë të llojit të egër.

Sa më i madh të jetë vlera e deleve, aq më pak i prekshëm është një ilaç i veçantë.

Këto vlera pastaj vendosen brenda shkallëve të ulëta klinike dhe ato të sipërme klinike, me vlera të sipërme që i japin niveleve më të larta të rezistencës së drogës. (Shih raportin e mostrës .)

Kur kryhet një test i rezistencës gjenetike?

Në SHBA, testimi i rezistencës gjenetike kryhet tradicionalisht në trajtimin e pacientëve naivë për të përcaktuar nëse ata kanë ndonjë rezistencë "të fituar" të drogës. Studimet në SHBA sugjerojnë se midis 6 dhe 16% të virusit të transmetuar do të jetë rezistent ndaj të paktën një ilaç antiretroviral, ndërsa gati 5% do të jetë rezistent ndaj më shumë se një klase të drogës.

Testimi i rezistencës gjenetike përdoret gjithashtu kur rezistenca e drogës dyshohet tek individët në terapi. Testimi kryhet gjatë kohës që pacienti ose merr regjimin e dështimit ose brenda katër javëve të ndërprerjes së trajtimit nëse ngarkesa virale është më e madhe se 500 kopje / ml. Testimi gjenotipik në përgjithësi është i preferuar në këto raste, pasi ato kushtojnë më pak, kanë një kohë më të shpejtë kthimi dhe ofrojnë ndjeshmëri më të madhe për zbulimin e përzierjeve të virusit të tipit të egër dhe rezistent.

Një kombinim i testeve fenotipike dhe gjenotipike është përgjithësisht i preferuar për personat me rezistencë komplekse, multi-të drogës, veçanërisht për ata të ekspozuar ndaj inhibitorëveproteazës .

burimet:

Organizata Botërore e Shëndetësisë (OBSH). "Fletë Informacioni për rezistencën ndaj drogës të HIV". Gjenevë, Zvicër; 11 prill 2011.

Kim, D .; Ziebell, R .; Saduvala, N .; et al. "Trendi i mutacioneve të lidhura me rezistencën e HIV-1 ARV të drogës: 10 zona të mbikëqyrjes së HIV, SHBA, 2007-2010". Konferenca e 20-të mbi Retroviruset dhe Infeksionet Opportuniste. Atlanta, Gjeorgji; 6 mars 2013; Përmbledhje gojore 149.

Institutet Kombëtare të Shëndetit (NIH). "Udhëzime për Përdorimin e Agjentëve Antiretroviralë në të rriturit dhe adoleshentët e infektuar me HIV". Bethesda, Maryland; 11 tetor 2013.